همان طور که می دانید، یکی از قابلیت های نرم افزار FileZilla ، مقایسه فایل های یک پوشه موجود در کامپیوتر خانگی (localhost) با پوشه ای در هاست (host) می باشد که فایل های مشابه را نمایش نخواهد داد و فایل های متفاوت را به صورت رنگی نمایش می دهد :

اگر نوع تفاوت را بر اساس filesize قرار بدهیم، ممکن است این مشکل به وجود بیاید که با وجود آپلود فایل، اندازه آن در دو پوشه، متفاوت نمایش داده شود (در صورتی که همان فایل را آپلود کرده ایم و باید اندازه ها یکسان باشند) :

برای برطرف کردن این مشکل، ابتدا از منوی Edit ، گزینه Settings را انتخاب می کنیم :

سسپس در پنجره ای که نمایش داده می شود، از شاخه Transfers ، گزینه File Types را انتخاب می کنیم و سپس Default transfer type را برابر Binary قرار می دهیم و در آخر بر روی گزینه OK کلیک می نماییم :